目的：探讨阿托伐他汀和辛伐他汀治疗原发性高脂血症的疗效及不良反应。方法：选取2023年6月～2024年6月本院收治的20例原发性高脂血症患者作为研究对象，依据不同的治疗方法作为分组方法，划分为对照组与观察组各10例，对照组采取辛伐他汀治疗，观察组实施阿托伐他汀治疗，并对两组临床疗效、治疗前后的血脂指标水平、不良反应等各项观察指标进行比较。结果：观察组治疗总有效率为90.00%，与对照组40.00%相比处于更高水平，治疗后对比两组各项血脂指标水平，均以观察组改善更为优异，对治疗有效率与血脂水平变化差异比较均存在统计学意义（P＜0.05）。两组治疗期间不良反应发生率为10.00%、20.00%，无统计学意义（P＞0.05）。结论：在原发性高脂血症治疗过程中，应用阿托伐他汀与辛伐他汀均能够发挥治疗作用，阿托伐他汀的治疗效果更为显著，有利于改善患者的血脂水平，具有推广价值。